Balık yetiştirme çiftliklerinde, kültür havuzlarındaki suların hem dezenfeksiyonunda  kullanılması hemde ortama verilen ozonun kısa bir sürede kendi hammaddesi olan oksijene ayrışarak sudaki oksijen eksikliğini gidermesiyle üreticiye daha sağlıklı ürün yetiştirme imkanı sağlamaktadır. Bu sonuçla tesisin de veriminide artırmış olmaktadır. Yemlerden bulaşabilecek hastalıklara karşıda ozon uygulamaları üretim prosesinde kullanılmaktadır. Ozonun balıkçılık sektöründe kazandırdığı en büyük avantaj tüm bu sonuçlarla üretim maliyetini azaltmasıdır.

Balıkçılık sektöründe ozon, ürünü, çalışma alanını, yerleri ve duvarları yıkamak, kiri ve atıkları gidermek ve suya oksijen kazandırmak amacıyla çok yönlü bir uygulamadır.

Genelde işletme suları sıvı veya toz klorla yada yüksek maliyetli değişik biyositlerle dezenfekte edilmektedir. Proses konveyörlerindeki bakterileri kısa sürede öldürmek için yüksek miktarlarda klora ihtiyaç duyulmaktadır. Kullanılan klor aynı zamanda ürünle de reaksiyona girip THM yada Tri-Halometan denen yüksek toksin ve kanserojen bileşenlerini oluşturmakta ve balık yüzeyinin rengini  etkileyip kalitesinin düşmesine neden olmaktadır.

Ozon ile yapılan işlemlerde ise ozon suda tekrar oksijene dönüşerek yok olduğu için üründe ve suda hiçbir kalıntı ve atık bırakmaz. Suyu oksijence zenginleştirir.

Çalışmalar ozonun klora nazaran bakterilerin hücre zarlarına karşı 51 kat daha etkili ve bakterileri öldürme hızı 3125 kat daha fazladır.

VAZ – VELHO ve EKİBİ :

Ozonun balıkların birkaç günlük soğuk depolama süresinde yüzey kontaminantlarını azalttığı ayrıca trimetilamin oluşumunu azaltarak, balığın duyusal kalitesini arttırdığı saptanmıştır.

Soğuk tütsülenen balıklardaki ozonlama işleminin, LİSTERİA MONOCYTOGENES sayısını etkili bir şekilde düşürdüğünü saptamışlardır.

HARAGUCCI ve EKİBİ :

Yapılan bazı çalışmalarda ozonun, özellikle suda hazırlanmış formlarının daha etkili olduğu belirlenmiştir. Taze uskumrunun ( Trachurus trachurus ), %3 NaCI ve 0.60 ppm ozon içeren solüsyonla 30 – 60 dakika muamele edilmesi durumunda toplam canlı sayısında 2 – 3 logaritmik birim azalma olduğunu saptamışlardır.

CHEN ve EKİBİ :

Dondurulmuş balık ürünlerinde ozonun destile su ve %3 NaCl içeren solüsyonunun Vibrio cholera, E.coli, S. Typhımurium, V. Parahaemolyticus ve S.aureus gibi mikroorganizmaları inaktive ettiğini belirlemişlerdir.

Balıkçılık sektöründe ozonun nerelerde kullanılabileceğini özetlersek;

•    Üretim ve Proses suyunun dezenfeksiyonunda,

•    Balık üretme çiftliklerinde ozon kullanımıyla üretim havuzlarında sudaki eksilen oksijenin ozonun nihai bozunma ürünü olan oksijene dönüşmesiyle bu eksikliği gidermesi, (Böylelikle ilave kullanılan sıvılaştırılmış oksijen tüketiminin düşmesi ve maliyetin azaltılmış olması)

•    Tesis ortamının hem ozon gazı hemde ozonlu su kullanılarak dezenfekte edilmesinde,

•    Tesiste çalışan personelin kıyafetlerinin, el ve ayaklarının ozon ile dezenfekte edilmesinde

•    Balık işleme tesisine ürünün ilk giriş noktasından itibaren ozonlu su kullanılmasıyla tesisin diğer bölümlerine mikrobiyal bulaşmanın engellenmesinde,

•    Üretim ve İşleme tesisinde kullanılan aletlerin dezenfeksiyonunda,

•    Üretilen ürünün ambalajında ozon kullanılarak ambalajın dezenfekte edilmesinde,

•    Ürünün ozon baskısı altında depolanarak raf ömrünün uzatılmasında,

•    Ürünün nihai tüketiciye ulaştırılırken kullanılan araçların ozon kullanılarak dezenfekte edilmesinde,

•    Ürünün nihai tüketiciye ulaştırılana kadar ki soğuk zincirde ozon gazı kullanılarak mikrobiyal üremelerin önlenmesinde,

ozon güvenle kullanılmaktadır.